Share your thoughts, 1 month free Claude Pro on usSee more

Perturbation prediction on Replogle

0.039DEOver

Squidiff

Updated 2mo ago

Evaluation Results

Method
Squidiff 2026.02	0.039	-10.19	0.091	0.419	0.432	0	0.079	0.366	0.089	4.641	2.077	0.5	0.501	0.501
Squidiff 2026.03	0.039	-	0.091	-	0.432	0	-	-	0.089	4.641	2.077	-	-	-
Linear 2026.02	0.068	0.991	0.074	0.353	0.535	0.056	0.085	0.435	0.058	0.013	0.074	0.519	0.517	0.667
Linear 2026.03	0.068	-	0.074	-	0.535	0.056	-	-	0.058	0.013	0.074	-	-	-
CellFlow 2026.02	0.11	0.757	0.093	0.442	0.472	-0.033	0.086	0.434	-0.003	0.0949	0.205	0.507	0.507	0.495
Mean Variant 2026.02	0.11	0.798	0.092	0.421	0.475	-0.024	0.088	0.45	0.002	0.0699	0.174	0.505	0.505	0.506
CellFlow 2026.03	0.11	-	0.093	-	0.472	-0.033	-	-	-0.003	0.0949	0.205	-	-	-
Mean Variant (per Batch) 2026.03	0.11	-	0.092	-	0.475	-0.024	-	-	0.002	0.0699	0.174	-	-	-
Mean Variant 2026.02	0.111	0.794	0.093	0.416	0.474	-0.027	0.089	0.453	-0.001	0.0711	0.175	0.502	0.503	0.501
Mean Variant (Overall) 2026.03	0.111	-	0.093	-	0.474	-0.027	-	-	-0.001	0.0711	0.175	-	-	-
Mean 2026.02	0.127	0.742	0.094	0.417	0.532	0.077	0.092	0.467	0.048	0.099	0.206	0.582	0.599	0.608
Mean 2026.03	0.127	-	0.094	-	0.532	0.077	-	-	0.048	0.099	0.206	-	-	-
CPA 2026.02	0.173	1	0.087	0.637	0.746	0.499	0.081	0.401	0.418	0.075	0.054	0.582	0.581	0.521
CPA 2026.03	0.173	-	0.087	-	0.746	0.499	-	-	0.418	0.075	0.054	-	-	-
Mean Variant 2026.02	0.178	1	0.087	0.417	0.743	0.492	0.078	0.404	0.412	0.0085	0.057	0.502	0.505	0.502
Mean Variant (per Cell Type) 2026.03	0.178	-	0.087	-	0.743	0.492	-	-	0.412	0.0085	0.057	-	-	-
PerturbDiff 2026.02	0.19	0.984	0.174	0.623	0.702	0.342	0.21	0.625	0.34	0.0147	0.081	0.69	0.7	0.575
PerturbDiff 2026.03	0.19	-	0.174	-	0.702	0.342	-	-	0.34	0.0147	0.081	-	-	-
STATE 2026.02	0.196	0.998	0.193	0.818	0.778	0.506	0.239	0.633	0.437	0.0064	0.055	0.788	0.802	0.676
STATE 2026.03	0.196	-	0.193	-	0.778	0.506	-	-	0.437	0.0064	0.055	-	-	-
PerturbDiff 2026.02	0.214	0.988	0.192	0.762	0.723	0.388	0.257	0.652	0.376	0.0146	0.079	0.758	0.762	0.639
SCALE 2026.03	0.601	-	0.345	-	0.979	0.871	-	-	0.909	0.0009	0.072	-	-	-